Monte San Calogero (anche Monte Kronio 388m) geologicamente è una grossa porzione di crosta terrestre piegata dalle forze tettoniche che la fanno emergere.
Per la sua conformazione geologica e morfologica sarebbe più corretto identificarlo come Sistema montuoso di San Calogero.

Presenta un complesso di grotte (stufe) pervase da aria calda sulfurea sprigionata dal sottosuolo di origine vulcanica, con acqua che raggiunge una temperatura intorno ai 38°C ed aria e vapori saturi di sali sulfurei utilizzati per curare malattie respiratorie e reumatiche.
Per la presenza delle grotte termali è riconosciuto dalla comunità scientifica come unico nel suo genere in europa.

Le grotte del Monte San Calogero furono utilizzate a scopi terapeutici fin dall’età degli antichi Greci. Le grotte furono abitate dal Neolitico Medio all’età del Rame fino al verificarsi dei fenomeni vulcanici secondari che portarono all’emanazione dei vapori sulfurei e all’innalzamento della temperatura al loro interno.

Nella riserva oltre le acque sulfure erano presenti altre tipologie di acque come acque medio-minerali e salsobromoiodiche tutt’ora presenti e bicarbonato-alcaline, chiamate Acqua Santa fino alla scomparsa in seguito al terremoto del ’68 della Valle del Belice.
I pochi ettari (circa 50) della Riserva sono caratterizzati da una pineta e qualche lembo di vegetazione rupestre. Sulla vetta trovano habitat idoneo alcuni rapaci tra cui il gheppio e la rara aquila del Bonelli.